一、做一次基因测序到底要花多少钱?
价格区间跨度极大,从几百到数万元不等,核心差异来自测序深度、检测范围、技术平台三大维度。

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1. 主流技术平台的价格对比
- 全基因组测序(WGS):30×深度约4000-6000元,100×深度可达1.2万-1.8万元
- 全外显子测序(WES):100×深度约2000-3500元
- 靶向Panel:50-500基因范围800-3000元
- 单基因病检测:如BRCA1/2单项600-1500元
2. 哪些隐形费用常被忽视?
除了测序本身,还需预留以下预算:
- 样本采集与运输:冷链运输费约50-200元
- 生物信息分析:标准分析500-1500元,高级解读2000-5000元
- 临床遗传咨询:三甲医院挂号费300-800元/次
二、基因测序流程是什么?从采样到报告的全景拆解
1. 采样环节:血液、唾液还是组织?
不同样本类型影响DNA得率:
- EDTA抗凝血:DNA得量高,适合WGS
- 口腔拭子:无创但得量低,适合Panel检测
- 新鲜组织:肿瘤检测金标准,需≥20%肿瘤细胞含量
2. 实验室处理:提取到文库构建的7个关键步骤
每个环节都有质控红线:
- DNA提取:浓度≥20ng/μL,260/280比值1.8-2.0
- 片段化:超声打断至200-400bp
- 末端修复:加A尾防止接头自连
- 接头连接:引入样本index防止混样
- PCR扩增:8-12个循环避免GC偏好
- 文库质检:Agilent 2100检测主峰300-500bp
- 上机测序:NovaSeq 6000单次运行可产出6Tb数据
3. 生物信息分析:从FASTQ到临床报告的转化
核心算法如何过滤噪音?
- 比对:BWA-MEM将reads比对至hg38参考基因组
- 变异检测:GATK HaplotypeCaller识别SNP/InDel
- 注释:ANNOVAR关联ClinVar、COSMIC数据库
- 过滤:剔除人群频率>1%的良性变异
- 临床解读:按ACMG指南分级(Pathogenic/Likely Pathogenic)
三、用户最关心的5个高频问题
Q1:做肿瘤基因检测需要穿刺新鲜组织吗?
不一定。液体活检(ctDNA)可替代70%组织检测场景,但检出限需突变频率≥0.1%。

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Q2:为什么同一家医院不同科室报价差3倍?
检测范围差异:肿瘤内科可能只测8基因小Panel,而遗传咨询门诊会测100+基因扩展Panel。
Q3:报告中的VUS变异该怎么办?
建议家系验证:若父母均未携带该变异,新发突变致病概率提升5-8倍。
Q4:全基因组测序能替代所有其他检测吗?
不能。WGS对拷贝数变异(CNV)检测灵敏度仅70%,需结合CMA芯片补充。
Q5:如何辨别测序公司的资质?
三看:
- CAP认证:实验室质控国际标准
- CLIA证书:美国临床实验室准入许可
- 国内PCR实验室验收:卫健委颁发的技术准入
四、2024年行业趋势:价格腰斩背后的技术推手
随着DNBSEQ-T20×2等国产测序仪量产,预计:

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- WGS价格将跌破2000元(30×深度)
- 纳米孔测序实时分析缩短至6小时
- AI解读工具使报告周期从15天压缩至72小时
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