基因测序多少钱一次_基因测序流程是什么

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一、做一次基因测序到底要花多少钱?

价格区间跨度极大,从几百到数万元不等,核心差异来自测序深度、检测范围、技术平台三大维度。

基因测序多少钱一次_基因测序流程是什么
(图片来源网络,侵删)

1. 主流技术平台的价格对比

  • 全基因组测序(WGS):30×深度约4000-6000元,100×深度可达1.2万-1.8万元
  • 全外显子测序(WES):100×深度约2000-3500元
  • 靶向Panel:50-500基因范围800-3000元
  • 单基因病检测:如BRCA1/2单项600-1500元

2. 哪些隐形费用常被忽视?

除了测序本身,还需预留以下预算:

  1. 样本采集与运输:冷链运输费约50-200元
  2. 生物信息分析:标准分析500-1500元,高级解读2000-5000元
  3. 临床遗传咨询:三甲医院挂号费300-800元/次

二、基因测序流程是什么?从采样到报告的全景拆解

1. 采样环节:血液、唾液还是组织?

不同样本类型影响DNA得率:

  • EDTA抗凝血:DNA得量高,适合WGS
  • 口腔拭子:无创但得量低,适合Panel检测
  • 新鲜组织:肿瘤检测金标准,需≥20%肿瘤细胞含量

2. 实验室处理:提取到文库构建的7个关键步骤

每个环节都有质控红线:

  1. DNA提取:浓度≥20ng/μL,260/280比值1.8-2.0
  2. 片段化:超声打断至200-400bp
  3. 末端修复:加A尾防止接头自连
  4. 接头连接:引入样本index防止混样
  5. PCR扩增:8-12个循环避免GC偏好
  6. 文库质检:Agilent 2100检测主峰300-500bp
  7. 上机测序:NovaSeq 6000单次运行可产出6Tb数据

3. 生物信息分析:从FASTQ到临床报告的转化

核心算法如何过滤噪音?

  • 比对:BWA-MEM将reads比对至hg38参考基因组
  • 变异检测:GATK HaplotypeCaller识别SNP/InDel
  • 注释:ANNOVAR关联ClinVar、COSMIC数据库
  • 过滤:剔除人群频率>1%的良性变异
  • 临床解读:按ACMG指南分级(Pathogenic/Likely Pathogenic)

三、用户最关心的5个高频问题

Q1:做肿瘤基因检测需要穿刺新鲜组织吗?

不一定。液体活检(ctDNA)可替代70%组织检测场景,但检出限需突变频率≥0.1%

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Q2:为什么同一家医院不同科室报价差3倍?

检测范围差异:肿瘤内科可能只测8基因小Panel,而遗传咨询门诊会测100+基因扩展Panel。


Q3:报告中的VUS变异该怎么办?

建议家系验证:若父母均未携带该变异,新发突变致病概率提升5-8倍


Q4:全基因组测序能替代所有其他检测吗?

不能。WGS对拷贝数变异(CNV)检测灵敏度仅70%,需结合CMA芯片补充。


Q5:如何辨别测序公司的资质?

三看:

  1. CAP认证:实验室质控国际标准
  2. CLIA证书:美国临床实验室准入许可
  3. 国内PCR实验室验收:卫健委颁发的技术准入

四、2024年行业趋势:价格腰斩背后的技术推手

随着DNBSEQ-T20×2等国产测序仪量产,预计:

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  • WGS价格将跌破2000元(30×深度)
  • 纳米孔测序实时分析缩短至6小时
  • AI解读工具使报告周期从15天压缩至72小时

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